自26年前開始進行各級醫療院所評鑑時，即要求各醫院必須具備完善的教學和研究，才能合乎醫學中心的標準。當時尚未成立醫學教育和醫學研究部門，由於缺乏標準的醫學教育與醫學研究，而使我們一直被評為「準醫學中心」，因此對醫學教育的加強，成為當時馬偕醫院階段性改善的重要目標。十多年前，馬偕醫院開始有了醫學研究部門的設立，後來醫學教育研究科一分為二，由現任楊育正副院長率領醫學研究部，而由梁德城主任帶領醫學教育部，而在醫院大力投入臨床、教學並重的均衡發展之後，即由醫教部擔任醫學教育之規劃、養成與培訓新進醫師的重要工作。
雖然是醫學教育部，但編制卻只有一名員工，再加上圖書組十餘位，近來正式編制增為三位，加上助理三位，圖書組仍有十餘位。
朝向專業發展
將醫學教育與醫學研究從整合到有所區分，主要的理由也是為了突顯醫院對醫學教育與研究的重視。各自獨立的結果，也讓兩部順利朝向專業發展。本院提供訓練醫學院醫學系見習醫師、實習醫師及住院醫師之任務，並接受各大專院校藥學系、醫技系、護理系、放射技術系、職能治療系、營養系等學生之實習。
實施教學數點制
目前院內教職人數已達245人，甚至比某些醫學院附設醫院還多。為鼓勵並規範院內教學風氣，設有「教學點數制度」，醫教部會依教學內容與時間，一般每教學二小時給予一點，每位主治醫師每年教學點數均須達到20點。這是在1996年由當時醫教部主任郭許達醫師創立。院方給予主治醫師固定薪水，而此固定薪水的三分之一定為教學薪資。
「教學點數制度」須有教學記錄，向醫教部登錄點數。主治醫師之教學點數每年須足夠，日後有關院內升等時，亦同時做為必備條件評核。
鼓勵優良醫師
一個常被討論的話題是，在教學醫院中，教學是否應有合理報酬？站在鼓勵醫師於臨床、研究之餘，還須花時間準備教學工作，因而會相對減少醫師其他可用的時間，因此醫學教育部主張：教學，包含教學住診及教學門診，均有一定的報酬鼓勵。
教導如何看病人
舉例來說，教導學生「如何看病人」，對見習醫師來說，往往是十分關鍵的第一步。透過基本臨床技巧的教學，包括如何向病人及家屬問診溝通、如何進行身體檢查、神經學檢查，如何加上檢驗結果進行整體初步的評估，以為病人籌劃下一步的檢查。任何一個動作，都必須在論理與實務中求取平衡，找到方法。就好比剛開始學騎腳踏車，哪有人不是在跌跌撞撞中才學會如何駕馭自如？
為使醫學教育的工作順利進行，本院醫學教育部更設置三個中心，分別是實證醫學中心、教師培育中心及臨床技能訓練中心，每個中心並有負責人負責安排各項教育課程與訓練。
成立三大中心
實證醫學最終目的是解決臨床實際問題，包括認識和預防疾病、提高診斷準確性、套用有效的措施改善預後並提高生存品質、促進衛生管理決策科學化，故與臨床醫療行為息息相關。
教師培育中心負責訓練住院醫師、主治醫師如何增長能力，作育學生。
而近年來，由於科技的進步，許多醫學臨床技能已經可以透過模擬演練來學習。醫教部為配合醫院推展以「病人為中心」與「病患安全」的醫療照顧，特設置臨床技能訓練中心，以模型進行各項臨床上所需的模擬訓練，包括插氣管內管、導尿等。並以真、假病人練習如何看病人，來增進對學員臨床教學的品質與效益。
小班制教學
除此之外，為強化教學效果，更積極實施小班制，鼓勵以互相提問方式達到互動教學的目的。
每年四次的醫學研究教育委員會中，實習醫師與見習醫師均會派代表出席，這除了是馬偕的傳統之外，也可以藉著會議廣納更多的意見，做為實習醫師與見習醫師參與相關決策的重要管道。
一對一導護老師
在成果驗收方面，亦會針對學生滿意度及教學雙向意見表進行評估。學生有一對一導師照顧，並有實習老師指導，另有醫學院指派本院主治醫師為該校學生的導護老師。幫助實習醫師複習準備國家考試。本院實習醫師國家考試通過率高達97%。
一步步的努力與規劃，醫學教育部的成長有目共睹，終在民國89年通過醫院評鑑，成為真正的醫學中心，民國94年度亦通過為醫學中心。
與醫學院校的建教合作，是醫教部的重要工作，其中馬偕醫院向來與馬偕護專的合作關係密切。
傳承醫學教育
從事醫學教育工作多年來，看到醫學系的學生人才輩出。現在的學生領悟力很強，很有主見與想法。而醫學教育的傳承，除了專業的醫學知識之外，還有更多在行醫的過程中應該要努力思考的問題。
秉持著醫學教育傳承的宗旨，醫學教育部始終扮演著薪火相傳的重要角色，面臨多元的醫療環境，醫學教育部亦同時需要更多的改進，唯有持續不斷的努力與堅持，才能將醫學教育延伸向下，樹立良好的醫學典範。